태일, 한솔, 아구몬, 텐타몬은 주위를 정찰하던 중 고철 더미가 잔뜩 쌓인 곳에서 과학자 가비지몬과 조수 츄몬을 만난다. 가비지몬의 연구소에서 이야기를 나누던 중 갑자기 레어몬이 나타나고 레어몬은 그레이몬, 캅테리몬과 싸우던 도중 배고픔을 느끼고 가버린다. 가비지몬은 츄몬들의 원수인 레어몬을 없애기 위해 만든 바주카포로 레어몬을 공격하지만 레어몬은 검은 번개의 힘으로 레어레어몬으로 진화한다. 한솔은 자신의 아이디어와 가비지몬의 발명품을 이용해 레어레어몬을 쓰러뜨리고 가비지몬은 서치몬으로 진화한 츄몬과 함께 연구를 위한 여행을 떠난다.