John Doe aide la police à résoudre le mystérieux meurtre d'un jeune disc-jockey de Seattle. Par ailleurs, il fréquente avec toujours autant d'assiduité Rachel Pembrocke, la neurologiste. Doe hésite cependant à poursuivre cette relation, qui pourrait déboucher sur une histoire d'amour, tant le tourmente l'ignorance qu'il a de son passé...