실력은 좋지만, 비싼 수술비를 받는 악명 높은 무면허 의사 블랙 잭은 여느 때처럼 제시한 300만 달러란 높은 금액을 수락한 환자를 치료하러 간다. 척박한 섬에 고성을 그대로 옮겨온 대부호 크로스워드는 원인 불명의 병으로 인해 주기적으로 극심한 경련과 고통에 시달리고 있었다. 80명의 명의를 만나봤으나 소용이 없었다는 그에게 고통을 완화해주는 유일한 약은 평범한 물이 전부다. 블랙 잭은 병의 수수께끼를 풀기 위해 크로스워드의 저택을 떠나 섬마을로 향하고, 그곳에서 같은 병을 앓는 마을 사람들과 키마이라 병에 대해 듣게 된다.